O fluxo é basicamente o mesmo para todos os exames. Em um primeiro momento, o técnico pega um tubo e o identifica junto ao sistema. Esse primeiro tubo recebe uma única etiqueta e o responsável não precisa, e nem deve, alterar o cadastro. Todo o trabalho é feito por meio de códigos de barras, com leitores para localizar as coletas, o que torna a administração bem mais prática.
Depois, o próprio sistema indica em quantos tubos aquela coleta deverá ser separada, e as amostras são encaminhadas ao setor de triagem, para que seja realizada a aliquotagem. Após a separação, cada tubo ganha uma etiqueta que identifica qual exame deverá ser realizado com a amostra.
Para realizar o controle de aliquotagem, é necessário controle por tubo (seco, EDTA, fluoreto), amostra (urina, sangue) e setor (bioquímica, hematologia, hormônios). Utilizar um sistema para o controle de aliquotagem gera menos trabalho para o técnico, que não precisa se preocupar com a separação. Essa automação diminui erros de identificação, já que as etiquetas saem prontas para serem aplicadas. Também é reduzido o tempo que o paciente precisa ficar no laboratório para realizar a coleta. Contudo, é importante ressaltar que o uso de sistemas não elimina os cuidados que os laboratórios precisam ter com a atenção e atendimento ao paciente.
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